集団遺伝学より②除外される堕落論

　
　集団遺伝学より②

　　　除外される統一原理の堕落論と原罪論

「アダムとエバは存在しない：集団遺伝学より」の続きで、
集団遺伝学より②除外される堕落論専門家による記事「アダムとイブについて遺伝学が語るもの」What Genetics Says About Adam and Eve
の翻訳の後半です。

難解な超長文になりますが、まずせめて私が青色文字にした部分（比較的わかりやすい、まとめ部分）だけでも読んでいただけたらと思います。　
末尾に、暗在感想。k

翻訳ここから

https://biologos.org/articles/what-genetics-say-about-adam-and-eve

頻度の頻度
The frequency of frequencies

変異を集団における頻度によって分類することは、アダムとイブに関する疑問に答えるための単なるトリックではなく、集団の歴史を探るために遺伝学者が用いる強力なツールなのです。このツールは、上で行ったように単に違いを数える以上に、その集団の歴史についてはるかに多くの情報を与えてくれます。

なぜなら、遺伝的変異はDNAの1コピーに生じた変化であり、全人口の何千、何百万（現在は何十億）ものうちの1コピーに生じた変化であるからです。
しかし、その頻度は一定ではなく、世代間で増えたり減ったりすることがあります。このようなことが起こるのは、その変異体を持っている人が、それを1人の子孫に伝えたならば、次の世代でも頻度は変わりませんが、2、3人以上の子孫に伝えたり、あるいは全く伝えないこともあるからです。

このように、たまたまその遺伝子を持っている人が多かったり少なかったりすることで、頻度は減ったり増えたりするのです。

長い間経つと、その変種は完全に消滅するか、あるいは引き継がれることになります。つまり、最終的に頻度は0％か100％になります。そうなると、ゲノム上のその部位は、もはや人々の間で差がなくなります。

この「遺伝子の漂流」のプロセスはゆっくりと起こります。どのくらいゆっくりかは、集団の大きさに依存します。
例えば、生存している個体が50人しかいない場合、そのうちの1人に新しい突然変異が起こると、頻度1％の変異型が生まれます。なぜなら、それは集団内の100のゲノムのうち1つに存在するので（50人×2ゲノムコピー/個）。
それが例えば3人の子供に受け継がれると、その頻度はたちまち3％に跳ね上がります。

一方、人口が50万人の場合なら、その変異体は100万人に1人の割合（頻度0.0001％）で存在し、1％になるまでに非常に多くの世代を要することになります。その結果、高い頻度で存在する変異体は、集団が大きければ古いもの、典型的には非常に古いものになります。

さらに、新しい変異体のほんの一部が、失われることなく高い頻度で漂うので、通常は一般的な変異体よりも希少な変異体の方が多く存在することになります。
集団の歴史が異なれば、どれくらいの数の希少な変種が存在すべきか、またその分布全体がどのようになるべきかを予測することができます。
例えば、これは人類が何百万年もの間、16,000人という一定規模の人口を維持してきた場合、どのような分布になるべきかをシミュレーションしたものです。

頻度分布、一定サイズの人口

見ての通り、高頻度よりも低頻度の変種がはるかに多いと予想されます。(気になる人のために説明すると、予想される関数形式は、fは各サイトにおける低頻度の塩基の頻度である)。

したがって、私たちがしなければならないことは、多数の人々のすべての遺伝子変異を集計し、それぞれの変異がどの程度一般的であるかを確認することです。これもまた、一般に公開されている数千のゲノムと、その中から発見された数百万の変異部位を用いて行うことができます。例えば、6番染色体の87,144,623位を見ると、そこに遺伝子変異があることが分かります。
その部位では、ゲノムの6％がCを塩基に持ち、94％がTを持つので、その変異体の頻度は6％であると言うことができます。これをゲノム上のすべての変異体について行うと、頻度分布の全体像が見えてきます。アフリカのゲノムの頻度分布（1000Genomesのデータを使用）を、上に示したシミュレーション曲線と一緒にプロットしてみました。
アフリカの遺伝的変異データ

両者の曲線はほぼ同じで、頻度が高いほどよく一致しています。先ほど述べたように、これは古いタイプの変種についてはよく一致することを意味します。
しかし、あまり一般的でない変種については、シミュレーションよりも実際のゲノムの方がより多く見つかっています。母集団が大きいと変種も多くなることを考えると、ある時点で祖先の母集団が大きくなったと結論づけることができます。
集団遺伝学者に言わせれば、この分布は、長期的には約1万6千人で、最近になって規模が拡大した集団のものであるように見えるのです。

この結論は、私たち人類の最近の歴史について知っている他のすべてのことと一致します：
つまりほとんどのアフリカの集団は、世界中のほとんどの集団と同様に、農業の発達のおかげで、ここ1万年ほどの間にその規模を大きく拡大したのです。

しかし、アフリカ人以外の祖先を持つ人々を見ると、全く違った光景が見えてくることは注目に値します。
例えば、ここではヨーロッパの様々な集団から集めたデータを加えてみました。

繰り返しになりますが、最も一般的な（＝最も古い）変種については2つの曲線は同じですが、より稀な変種について見ると、ヨーロッパ人は一定規模の集団から予想されるよりも少ないのです。先ほどの論理でいくと、ヨーロッパの人口がある時点で実際に小さくなったということになります。それは本当でしょうか？

実は、これは非常に理にかなっています。現在のところ、現生人類は20〜30万年前に初めてアフリカに出現し、それ以来ずっとそこに住み続けているというのが我々の理解です。
そして、比較的最近になって、おそらく6、7万年前から、そのごく一部がアフリカから世界の他の地域に移動し始めたのです。この小さな移住集団は、遺伝学の用語で言うところの「ボトルネック」と呼ばれ、ここに見られる頻度分布にその痕跡を残しています。

もちろん、集団遺伝学者はこのようなプロットをただ眺めているだけでなく、分布を詳しく調べ、数学的な解析を行います。しかし、彼らの大まかな結論は、ここで述べたものと同じです。
多くのローカルな人類集団は、その歴史のある時点でボトルネックを経験しているが、集団全体として、特にサハラ以南のアフリカの多くの集団は、少なくとも数十万年前から数千人規模の集団であったようです。

このデータを素直に解釈すると、私たちの祖先は、私たちが見ることができうる限り遡っても、数千の集団の一部であったということになります。
つまり、最初の質問に対する答えは「ノー」です。遺伝子のデータは、私たちの祖先の集団が一組の夫婦から構成されていたという証拠を示していないのです。

しかし、まだ疑問が残ります。このデータは、本当に一組の祖先を除外しているのでしょうか？
そして、この質問には、元のペアの遺伝的多様性を任意に許容した上で答えなければならないことを忘れてはなりません。

残念ながら、これは科学文献が直接的に教えてくれる問題ではありません。科学者はアダムとイブについて考えることに多くの時間を費やしておらず、アダムとイブが遺伝子データと適合しているかどうかを考えていないのです。ですから私たちは、非公式な努力と一般的な集団遺伝学の原則に頼らざるを得ないのです。

アダムとイブという2つの個体がボトルネックになったとする説が遺伝学的データに合致するかどうかは、彼らがいつ生きていたかに大きく依存するのです。
聖書の年代測定に対する一般的な伝統的アプローチのように、1万年前以内に生きていた一組の祖先と、50万年前に生きていた一組の祖先では、全く異なる問題が生じます。
その理由を知るために、もう一度この頻度分布を見てみましょう。もし、私たち全員が1万年前の一組の子孫であったとしたら、どのような分布になるのでしょうか。以下は、そのシナリオの簡単なシミュレーションです（アフリカのデータも再掲載しています）。

グラフ　一組の夫婦の遺伝的変異（1万年前）シミュレーション

このシミュレーションでは、初源のカップルの間で、頻度の高い変異体をすべて考慮できるよう、できる限り多くの変異を創り出しました。(このとき、頻度の高い変異体が突然変異に由来するように見えるという、上で述べた問題は無視することにします）。ゲノムが4つしかない場合（つまり2人の人間が持っているもの）、すべての変種の頻度は最低でも25%です。

その後のドリフトによって、高い頻度の変異体は取り除かれますが、データに見られるような、低い頻度で滑らかに上昇する特徴的な曲線は作れません。それは突然変異に由来するものでなければならないのです。このカーブを描くには、長い時間と大きな集団が必要です。
それは小さな集団では私たちが見るようなレベルの多様性を維持できないからであり、大きな集団では変種頻度がゆっくりと漂うので長い時間がかかるからです。
シミュレーションの左端にある小さな変動線が示すように、1万年というのは、それほど多くの突然変異を蓄積するのに十分な時間とは言えません。　

十分な突然変異が起こって、より高い頻度までドリフトするためには、どれくらいの時間が必要でしょうか？私自身が行ったシミュレーションでは、最短で約50万年でした。それ以下では、低頻度の変異が少なすぎます。

同様の結果は、アン・ゴーガーとオラ・ホスハーによって得られました。彼らは、独自のシミュレーションでより系統的な分析を試み、アダムとイブの特別な創造を含み、かつ遺伝子データと整合するシナリオを探しました。(彼らはその結果をディスカバリー研究所のインテリジェント・デザイン専門誌「BIO-Complexity」に発表している）。

このような分析から得られるあらゆる示唆は、遺伝子データは過去50万年以内に一組の祖先が存在したことを事実上否定している、ということです。
そうすると、アダムとイブはホモ・サピエンスが出現するよりもずっと前に存在したことになり、より古いホモ属（ヒト属）の一員であったことになります。

　頻度だけではない

私がこれまで頻度分布について多くの時間を費やしてきたのは、それが人類の歴史を再構築するための唯一または最良のアプローチを提供するからではなく、少なくとも他のアプローチと比較して、直感的で視覚的にわかりやすいからです。

遺伝データからより多くの歴史的情報を抽出する、より洗練された手法も数多く開発され、人類の歴史を探るために利用されています。
ここでは、これらの手法のうち、どのようなものがあるのかを知るために、もう少し簡単に触れてみることにします。

これらの手法は、頻度ベースの手法のように、ゲノム全体から情報を集めるものではありません。
そうではなく、ヒトゲノムの各セグメントは独自の系譜を持ち、その系譜は、先に述べたゲノムのビットの「混合」である組み換えが進行しているため、隣接するセグメントの系譜とは異なるという事実を利用するのです。
この系図は、様々な人のゲノムに存在する遺伝子変異をもとに再構築することができます。そして、木の各枝の長さ（世代で測る）は、その枝に沿って蓄積された突然変異の数から推定することができます。
第二段階として、木の形から祖先集団の大きさを推定することができる。例えば、ある時期に多くの枝が集まっている場合は、その時期に祖先が少なかったことを意味します。

研究者たちはこの手法を用いて、世界中のさまざまな現代人の集団を過去にさかのぼって、祖先となった人類の集団の規模を復元しました。

アフリカ以外の集団はすべて数万年前に実質的なボトルネックが生じた形跡があるのに対し、アフリカの集団は少なくとも数十万年前からずっと大規模だったように見える、というものです。
例えば、2019年のある研究では、フィンランド人の祖先の有効人口規模が一時は2000人と低く見積もられたのに対し、アフリカの集団の最小規模は8000人から12000人の間で、集団によってばらつきがあることがわかりました。

特に多様性が生み出される中で、こうしたより洗練された手法の結果はどの程度確かなものなのだろうか。
研究者の一人、ワシントン大学のジョシュア・スワミダス教授は、この問題を深く考察しました。彼は、各DNAセグメントについて、再構築された明確な遺伝的系統の数を調べました。現在では、1つのゲノムに対して1つの系統が存在し、さらに過去にさかのぼると、系統が共通の祖先で合流するため、その数は減少します。
重要なのは、4つ以上の系統が存在する限り、それを受け継ぐ個体が2人以上いたはずだということです。
つまり、50万年以上前に、1組の原初的な夫婦が生きていたはずだというのが、彼の結論です。
このように全く異なるアプローチで、データは先に示したのと同じような答えを指し示していることがわかります。

私の祖父、ネアンデルタール人

近年、私たちの祖先について、もう一つの情報源である古代のDNAの存在が明らかになりました。
何千年も前の骨から採取されたDNAによって、私たちの多くは、約45,000年前までヨーロッパの大部分とアジアの一部に住んでいたネアンデルタール人の祖先とわずかながら辿っていることが明らかになったのです。

実際、先祖が最近のアフリカ系でない人は皆、ゲノムの中にネアンデルタール人のDNAをいくらか持っているのです。
また、多くの人が、同じ時代にアジアに住んでいたと思われる関連集団、デニソワ人のDNAを受け継いでいます。
さらに、アフリカでも同様の「旧人」との交雑があったことを示唆する証拠があるが、その源となった集団を特定できるほど古いDNAがアフリカ大陸から得られていないため、それについてはあまりわかっていません。

これらの発見は、これら古代の集団が、現代人に発展した主な集団から切り離された期間が長いため、我々の疑問と関連しているのです。
この期間の推定値は、30万年から80万年と幅があり、最近の推定値は50万年以上です。
つまり、もし私たちがたった一組の夫婦から生まれたのであれば、その夫婦はそれよりもずっと昔に生きていたはずだということです。
現代人の祖先が、ヨーロッパとアジアに住んでいた人もいれば、アフリカに住んでいた人もいたずっと以前にです。

古代のDNAから得られた結果には、もう一つ素晴らしい特徴があります。それは、突然変異によってもたらされる時計は常に同じ速度で動いている、つまり、突然変異は常に現在と同じ速度で起こっている、ということです。

もし、突然変異の発生率が過去にもっと高かったとしたら、私たちが再構築した歴史の正しい時間スケールは大幅に圧縮されることになります。例えば、複数の突然変異のプロセスをすべて同じだけ加速する必要があり、その結果、私たちの目に見えない遺伝病や障害という恐ろしい負担が残ることになるからです。
しかし、古代のDNAは、長い期間にわたって実際にどれだけの突然変異が起こったかを数えることができるのです。
例えば、研究者が、40万年前のスペインに住んでいた古代の人類からDNAを復元したところ、それらの個体が蓄積した突然変異は現代人のそれよりずっと少なく、その差は、現代人が既知の突然変異率でさらに40万年分の突然変異を蓄積した場合に予想されるのとほぼ同じであることがわかりました。

これまで見てきたことをまとめると、今日の人類に見られる遺伝的変異は、私たちの祖先がただ一組の夫婦に由来するという確証を何ら与えてはいません。
もし、そのような夫婦が50万年以内に生きていたというならば、遺伝子のデータから、そのような夫婦は存在しないと否定されます。
さらに、私たちの多くがネアンデルタール人やデニソワ人の祖先を持つという圧倒的な証拠があります。

これらの集団は、現代人の祖先の本流から分離して久しいので、唯一の祖先である１組の夫婦を辿るなら、やはり50万年以上前に生きていなければならなかったことになります。
さらに時代をさかのぼると、遺伝子の変異は単独祖先のカップルを除外する力を失ってしまいます。集団遺伝学は強力ですが、その限界もあります。

では、このような証拠がある以上、クリスチャンはアダムとイブをどうしたらよいのでしょうか？
それは、私が言うべきことではありません。私は遺伝学を研究しているのであって、神学を研究しているのではありません。
アダムとエバが最近の歴史上の人物であり、また私たちの唯一の遺伝的祖先であると考えたことがない人にとっては、これらの発見はあまり重要ではありません。

しかし、歴史的解釈が重要な人々にとっては、選択肢はまだ残されています。
バイオロゴス・サイトの共通の疑問：「アダムとイブは歴史上の人物だったのか？」を見てください。（リンク）https://biologos.org/common-questions/were-adam-and-eve-historical-figures/

例えば、アダムとイブをこれらの研究が調査できる時代よりもずっと昔に位置づけることや、アダムとイブは特別で歴史的な二人組で、現在生きているすべての人の祖先である大きな集団の一部であったと仮定することなどが考えられます。

しかし、アダムとイブの物語が提起する大きな問題、すなわち被造物であるとはどういうことか、人間とは何者か、神との関係はどうあるべきか、あるいはどうありうるか、が神学と信仰の問題であり、科学ではないことは明らかです。

著者について
スティーブン・シャフナー

Stephen Schaffnerは、Broad InstituteのInfectious Disease and Microbiome Programの上級計算生物学者で、宿主、ウイルス、マラリアの遺伝学を含むヒト感染症の遺伝学について研究しています。
ヒト集団遺伝学の分野でも幅広く活躍し、ヒトの遺伝的変異に関する最初の体系的研究、国際ハップマップ・プロジェクト、1000ゲノム・プロジェクトに貢献している。また、遺伝的変異に対する正の選択の効果を検出する技術を開発し、人間の人口動態史に関するモデルベースの研究を行い、マラリア原虫における最近の共通祖先を特定するためのツールを開発した。
シャフナーは元実験物理学者で、1999年にホワイトヘッド／MITゲノム研究センターに加わり、ブロード研究所の設立と同時にその一員となった。エール大学で物理学の博士号を取得した。

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サイト説明：バイオロゴスでは、
聖書を真摯に受け止め、神の創造を科学的に理解することに情熱を持って取り組んでいます。
ここ数十年の間に、遺伝学に対する理解は飛躍的に進み、人類が地球上のすべての生物と共通の祖先を持つという圧倒的な証拠が得られています。

バイオロゴスでは、ホモ・サピエンスが進化し、約20万年前に誕生し、地球上の他のすべての生物と共通の祖先を持つということ、さらに今日の人類の遺伝的多様性は、たった二人のホモ・サピエンスから生まれたのではなく、何千人もの集団から生まれたと考えられる科学的証拠に説得力を感じています。

翻訳ここまで

ここから急に話の程度が下がりますが、
このような現代の発達した科学からは明らかに除外される堕落論、原罪論を主張する統一教会（家庭連合）ですが、教団の対策本部では「信仰の論理だ」などと言ってごまかすのでしょうか。いや、そんなことすら言わないでしょう。迷信の論理ですね。

昔は教団本部の反対牧師対策担当をしていたこともあるという777双ブロガー師観さんの記事より引用：
「統一教の原罪論の恐ろしいところは、全人類はすべて原罪を持っているので文教主の逆不倫の性の儀式を通さないと誰も救われないと説いているところです。
血統転換論は血代交換、すなわち血分のカルトの系譜に位置づけられる教義なのです。」
http://katsuwatanabe.blog.fc2.com/blog-entry-609.html

対策さんは分かっていたのでしょう。
“ 文教主の逆不倫の性の儀式”は、現在でも三日行事の手順の中に象徴的に組み込まれているので、“彼らには弁解の余地がない”。
韓鶴子現教主が三日行事を廃止する（した？）という話があったと思いますが、さもありなん。しかしどちらにしても（文教祖にしろ韓教祖にしろ）自分が人類のメシアだって、もう流行らないですね。その考えは、集団の中でしばらくドリフト（浮遊・漂流）して消えてゆく変異体の遺伝子のようなものでしょう。
（万人がメシアになれというなら、それはもうメシアではありません。メシアとは言いません。）

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